Description

Méthodes d’apprentissage automatique. Similarité et diversité de molécules. Chimie combinatoire théorique. Notion de l’espace chimique

• Concept de l’espace chimique. Arbres de châssis moléculaires. Paires moléculaires correspondantes
• Méthodes de visualisation et d’analyse de données chimiques : cartes de Kohonen, cartes topographiques génératrices.
• Criblage virtuel. Filtres (les règles de Lipinski et autres) et alertes structurales. Docking d’un ligand dans une protéine. Fonctions de score. Evaluation des performances d’un criblage.
• Préparation de chimiothèques. Méthodes d’analyse de groupements d'objets chimiques : clustering hiérarchique et non-hiérarchique. Génération de chimiothèques combinatoires. Chimiothèques "ciblées" et "diversifiées".
• Travaux pratiques avec les logiciels ISIDA-GTM et LigandScout.

Compétences visées

• Analyser un jeu de données chimiques à l’aide des méthodes « Arbres de châssis moléculaires » et « Paires moléculaires correspondants ».
• Visualiser l’espace chimique d’un jeu de molécules en utilisant les cartes SOM ou GTM.
• Effectuer un criblage virtuel en utilisant les filtres, les pharmacophores, le docking.
• Préparer une chimiothèque ciblée ou diversifiée.

Contacts

Responsable(s) de l'enseignement

• Alexandre Varnek

MCC

Les épreuves indiquées respectent et appliquent le règlement de votre formation, disponible dans l'onglet Documents de la description de la formation.

Régime d'évaluation

CT (Contrôle terminal, mêlé de contrôle continu)

Coefficient

3.0

Évaluation initiale / Session principale - Épreuves

Seconde chance / Session de rattrapage - Épreuves