Description

Représentation de structures par ordinateur. Bases de données en chimie.

• Eléments de base de théorie de graphes. Tables de connexion et présentation linéaires.
• Chaînes SMILES et InChi. Empreintes moléculaires. Pharmacophores.
• Formats MOL, SDF, RXN et RDF
• Recherche structurale et sous-structurale. Analyse conformationnelle.
• Critères de similarité de Tanimoto, de Dice et de Tvetsky. Recherche par similarité simple et par une fusion de données
• Bases de données populaires : CAS (SciFinder), Reaxys, ChEMBL, PubChem, ZINC, ChemSpider
• Outils de ChemAxon pour analyser et manipuler de données chimiques et pour créer une base de données chimiques.
• Travaux pratiques avec les logiciels Marvin, Standardizer et InstantJChem (ChemAxon).

Compétences visées

• Créer et/ou de gérer des bases de données chimiques.
• Rechercher des structures dans une base de données en combinant différents types de requêtes(par structure/sous-structure/similarité entre autres).

Contacts

Responsable(s) de l'enseignement

• Alexandre Varnek

MCC

Les épreuves indiquées respectent et appliquent le règlement de votre formation, disponible dans l'onglet Documents de la description de la formation.

Régime d'évaluation

CT (Contrôle terminal, mêlé de contrôle continu)

Coefficient

3.0

Évaluation initiale / Session principale - Épreuves

Seconde chance / Session de rattrapage - Épreuves