Vous êtes ici :  Accueil   >   Formations   >   Masters   >   Chémoinformatique (CI)

Chemoinformatics

  • Cours (CM) 10h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) 10h
  • Travaux pratiques (TP) -
  • Travail étudiant (TE) -

Langue de l'enseignement : Anglais

Description du contenu de l'enseignement

Recherche de structures dans une base de données. Modélisation structure-activité. Criblage virtuel. Préparation des chimiothèques.
  • Codage de structures chimiques : chaînes SMILES et InChi, empreintes moléculaires, pharmacophores, tables de connectivité, descripteurs moléculaires.
  • Recherche structurale, sous-structurale et par similarité.
  • Bases de données populaires : CAS (SciFinder), Reaxys, ChEMBL et PubChem.
  • Construction et validation des modèles « structure-propriété ».
  • Criblage virtuel. Filtres et alertes structurales. Docking d’un ligand dans une protéine.
  • Préparation de chimiothèques "ciblées" et "diversifiées".
  • Travaux pratiques avec les logiciels Marvin, Standardizer et InstantJChem (ChemAxon), ISIDA-QSPR et LigandScout.

Compétences à acquérir

  • Rechercher des structures dans une base de données en combinant différents types de requêtes (par structure/sous-structure/similarité, entre autres).
  • Obtenir et valider de modèles « structure-propriété ».
  • Effectuer un criblage virtuel en utilisant les filtres ou les pharmacophores.

Contact

Faculté de Chimie

1 RUE BLAISE PASCAL
67008 STRASBOURG
0368851672

Responsable

Alexandre Varnek


MASTER - Chimie