Bien qu’à vocation professionnelle, les étudiants ayant effectués le master chemoinformatique pourront éventuellement poursuivre leurs études par une thèse en chimie informatique et théorique.
Les étudiants titulaires du Master Chemoinformatique peuvent s’insérer dans divers secteurs industriels : dans les domaines de l’industrie chimiques et pharmaceutiques, en occupant des postes de modélisateurs (chimie, biologie, docking, génomique), de concepteur de bases de données chimiques ou de criblage virtuel, d’analystes de chimiothèques, dans les domaines de l’informatique comme programmeur ou analyste. Les débouchés pourront également s’effectuer dans des entreprises de hautes-technologies. ou dans les secteurs de l’informatique industrielle (Création et diffusion de logiciels pour la chimie, logiciels de gestion ou de conduite de procédés, logiciels pour l’appareillage scientifique etc.)
Les étudiants ayant obtenus leur diplôme en chemoinformatique ces dernières années ont trouvés des postes soit en chemoinformatique soit en informatique dans des grandes entreprises internationales comme Merck (Darmstadt), Nestlé (Lausanne) ou dans des PME telles que Discovery Engineering (Région Parisienne), ChemCad (Obernai), Chrysalen (Région Lyonnaise).
Parmi ces étudiants, six personnes ont décidé de poursuivre leurs études en effectuant une thèse à l’UDS (4 personnes), à l’Université de Sheffield (1) et à l’Ecole Polythechnique - Paris (1).